Γενικά, όταν έχεις τέτοιο ζήτημα, χωρίζεις τα Φ/Β πάνελ σε ομάδες με κοινά χαρακτηριστικά και χρησιμοποιείς ξεχωριστούς ρυθμιστές/εισόδους MPPT για την κάθε ομάδα.
Δώσε λεπτομέρειες γιατί μπορεί να υπάρχουν και άλλες λύσεις κατά περίπτωση.